1938年，国军副参谋总长白崇禧来到西宁视察后，马麟想要以宗教关系来讨好白崇禧，他在谈话中问白一天做几次礼拜，不料言出碰壁，白崇禧一脸不高兴的告诫他：“我不做礼拜，你以后不要礼拜，以免耽误政事。”马麟见言不投机，便灰头土脸的借故离开了。 1937年，马麟结束在麦加的行程，启程回到了国内，回国之后，他先是来到了南京，面见蒋介石，表示自己年老体衰，已经无法胜任青海省府主席一职，蒋介石则对他进行了安抚和挽留，马麟便打消了辞任的这个念头和想法，回到了河州。 当时，暂任青海省府主席一职的马步芳对于马麟的归来，心中十分的失望和不满，为了给马麟试施压，让他辞职，马步芳不仅没有派人去欢迎和迎接马麟，反而是派魏敷等人去往河州，阻止马麟回到西宁。 但是魏敷等人的阻止却并没有任何的作用，马麟还是回到了青海，回归到了他青海省府主席的职务上，马步芳则对此十分不满，开始秘密发动“索薪运动”给马麟进行施压，想把马麟挤出青海的历史舞台。 但是马步芳的这些施压手段并没有让马麟知难而退，马步芳便开始寻摸着借助白崇禧的力量来将马麟赶下台。 为此，马步芳便派出下属马绍武，携带巨额黄金，以及青海出产的猞猁和虎等贵重物品前往南京，将这些物品和黄金作为礼物送给白崇禧，并细数马麟的年老昏聩，已经不能够在胜任青海省府主席一职。 白崇禧在接受到了马步芳贵重的礼物后，便在1938年7月，以检阅军队为名来到了青海，而马步芳则是亲自带着人前往迎接，并安排白崇禧住到了自己的军部，当晚，马步芳与白崇禧密谈一晚。决定将马麟调任国民政府委员，青海省主席一职则由马步芳来担任。 与此同时，作为青海省主席的马麟则是在第二天来拜会白崇禧，马麟本想着用言语来讨好白崇禧，结果却遭到了白崇禧的警告，令马麟灰头土脸的离开了，马麟回去之后，琢磨一番后，便让自己的长子马步荣给白崇禧送来了一匹骏马作为礼物，白崇禧则婉言谢绝了。 马步芳这边得知马麟送马遭拒后，便让副官给马步芳送去了各色大马三十匹，白崇禧则是面带微笑的照单全收。 白崇禧在西宁待了四天，便结束行程，飞回了南京，回到南京后不久，马麟便被免去了青海省主席一职，而接替的自己便是马步芳，马麟见事已至此，便收拾好行囊，退居河州凯藏老家，深居简出局，不问世事，过起了他的田园生活。
